当女方起诉离婚而结婚证在男方手中时，她可以这样处理。
在那里，工作人员会根据她的身份信息等相关资料，为她开具一份婚姻关系证明。
这份证明和结婚证的法律效力是完全一样的，它能够证明双方的婚姻关系存在。
接着，女方就可以凭借着这份证明，向法院正式提起离婚诉讼。
在诉讼的整个过程中，法院会严格依照相关的法律规定以及所提交的各种证据来对案件进行审理。
如果在后续的程序中，确实需要用到结婚证的原件，那也不必过于担心。
等到法院判决离婚之后，女方可以通过婚姻登记机关或者其他合法的途径，去补办结婚证。
总的来说，结婚证在男方那里并不会对女方起诉离婚造成阻碍。
只要女方能够准备好合法有效的证明材料，法院就一定会依法进行审理和判决，以保障双方的合法权益。
二、女方起诉离婚男方藏证件能立案吗
女方起诉离婚，男方藏证件一般不影响立案。起诉离婚需提交民事起诉状、证明夫妻关系的材料等。结婚证是证明夫妻关系的重要证件，但即便被男方藏起来，女方仍可持本人身份证到当初办理结婚登记的婚姻登记机关申请出具婚姻登记记录证明，该证明效力等同于结婚证。
此外，立案还需明确原告与本案有直接利害关系、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实理由等法定条件。只要女方准备好符合要求的起诉状，并能提供证明夫妻关系的材料，即便男方藏证件，法院也会依法受理立案。所以，从法律规定来看，男方藏证件这一行为不会必然导致无法立案。
三、女方起诉离婚男方藏证件影响立案吗
一般情况下，男方藏证件不影响离婚案件立案。起诉离婚时，女方需向法院提交离婚起诉状、身份证明（如身份证）、结婚证等基本材料。
若结婚证被男方藏起来，女方可到婚姻登记机关申请出具婚姻登记记录证明，该证明与结婚证具有同等法律效力，凭借此证明和其他必备材料仍可立案起诉。身份证若丢失，女方可补办临时身份证，临时身份证在有效期内同样具有证明身份的作用，不影响立案流程。
立案主要审查的是是否符合起诉条件，包括原告是与本案有直接利害关系的公民、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实理由等。证件被藏通常不会导致不符合这些起诉条件，所以基本不会影响立案。
当面对女方起诉离婚结婚证在男方这种情况时，这只是离婚过程中的一个小阻碍。其实，即使结婚证在男方手中，女方依然可以顺利起诉离婚，凭借相关证明材料即可。除此之外，在离婚诉讼中还有很多与之紧密相关的问题。比如，没有结婚证的情况下财产该如何进行合理分割，是按照双方共同意愿还是依据法律规定？孩子抚养权归属又如何确定，法院会综合考虑哪些因素？若你对女方起诉离婚结婚证在男方时财产分割、抚养权争取等相关问题存在疑问，不用烦恼，点击网页底部的“立即咨询”按钮，专业法律人士将为你详细解答。
