商业合作协议是否违法
依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合作共建协议本身并无违法之嫌，参与各方均有权依据具体情况为合作共建事宜制定相应的协议条款。
然而，如果双方在拟定协议内容时存在恶意欺诈、威胁利诱以及违反国家法律法规强制性规定等不当行为，则该协议将被视为无效。在此特别忠告，在制定合同时务必遵循以下两条基本原则：一是《民法典》第五条所主张的合法自愿准则：即所有的民事主体在进行民事活动时均应秉持自主决定的原则，通过自身的行为设定、调整或赋权、消解民事法律关系；二是第一百五十三条所揭示的法律和行政法规禁止性规定：如有违反，将导致该项民事法律行为无效，除非这些禁止性规定并不导致整个民事法律行为失效且其违反公共秩序和良好习俗。
《民法典》第五条
民事主体从事民事活动，应当遵循自愿原则，按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。
《民法典》第一百五十三条违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。违背公序良俗的民事法律行为无效。
二、合作协议未备案是否违法？
合作协议未备案一般不违法。备案并非合作协议生效的必要条件，除非法律、行政法规明确规定某些类型的合作协议必须备案，否则未备案不影响协议的法律效力。
然而，未备案可能会带来一些潜在风险。例如，在发生纠纷时，对方可能以未备案为由主张协议无效或存在瑕疵，从而影响自身权益的维护。
如果合作协议中约定了备案条款，且双方都有按照约定履行的义务，那么未备案可能构成违约。
总之，未备案本身不一定违法，但可能会对协议的效力及后续的权益保障产生影响。建议在合作协议中明确约定备案事宜及相关责任，以避免可能出现的法律风险。
三、合作协议签订后是否具有法律效力
合作协议签订后通常具有法律效力。一般来说，只要协议的签订符合法律规定的形式要件（如双方签字盖章等），且协议内容不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议就对双方具有法律约束力。双方应当按照协议的约定履行各自的义务，否则可能会承担违约责任。但如果协议存在欺诈、胁迫等导致意思表示不真实的情形，或者协议的内容存在歧义无法确定等情况，可能会影响协议的法律效力，需要根据具体情况进行判断和处理。
商业合作协议本身不违法，但需遵循《中华人民共和国民法典》的规定。协议内容不得存在恶意欺诈、威胁利诱或违反国家法律法规强制性规定等不当行为。制定合同时，应遵守合法自愿和法律行政法规禁止性规定原则，否则可能导致协议无效。
