针对该问题，我们可以采用以下五个方法加以妥善解决：首先是协商解决，这种方式意味着在有关合同时产生的纠葛的任一方当事人都具有高度的耐心以及无私的善意，在彼此充分理解的基础之上，通过对事实真相的明确认识以及具有说服力的观点的表达，成功地制定出和解执行方案，从而使得合同纠纷得到自我消解；其次是调解处理，对于涉及到合同类型的纠纷，调解工作的核心在于纠纷的双方当事人自愿选择由中立的第三方机构人员介入，在他们的居间调解以及人性化劝导的推动下，尽力促使当事人之间能够相互体恤、互相礼让，并最终达成和解协议以结束纠纷问题；再者是仲裁处理，合同仲裁是指独立于争议之外的第三方机构依据已经签署的仲裁条款或者基于双方当事人自主达成的仲裁协议，遵循国家相关法律法规，对出现的合同争议问题进行合理裁决的措施；此外还有诉讼处理，诉讼被视为终结合同纠纷的最后也是最具效力的手段。
所谓诉讼，即指法院基于合同当事人的申诉与请求，在各方诉讼参与人员共同努力的参与之下，展开公平合理且合法审慎的司法审理工作，以此实现审理和解决合同争议方面的实际效果。
《中华人民共和国民法典》第四百六十四条
婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议，适用有关该身份关系的法律规定；没有规定的，可以根据其性质参照适用本编规定。
二、农村房屋产权纠纷怎么处理
发生农村房屋产权纠纷，双方应按平等互利、协商一致的原则协商处理，协商不成的可以请求村民委员会、乡镇人民政府进行调解。
除此之外，可以由双方指定的机构进行仲裁，仲裁未解决的，可以携带相关材料向辖区人民法院提起诉讼。
《中华人民共和国仲裁法》第二条
平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十五条
当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。
《中华人民共和国民法典》第二百三十三条
物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。
法律是一种强大的工具，它可以保护弱者，制约强者，维护社会的公正和公平。但是，法律的力量并不仅仅在于它的规定和惩罚，更在于我们每个人的理解和遵守。正如本文的标题所提出的问题，“农村房屋侵权和确权纠纷怎么处理”，我们每个人都有责任和义务去学习和理解法律，去遵守法律，去维护法律的尊严和权威。只有这样，我们才能真正实现法治社会的理想，才能真正实现公正和公平。
