房屋产权纠纷的处理方法有：
一是协商解决，二是仲裁解决，三是司法诉讼。协商解决应按照平等互利、协商一致的原则。仲裁解决是合同纠纷中最常见的一种方式。如协商、仲裁均未达成合议，可向人民法院提请诉讼解。
《中华人民共和国仲裁法》第二条
平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十五条
当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。
《中华人民共和国民法典》第五百七十七条
当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
法院并不会受理小产权房屋的纠纷起诉，因为小产权房屋是没有产权的，不受法律的保护。小产权房存在的一个重要原因就是它的价格非常便宜，给很多无力买房但又有住房需求的人提供了一条买房捷径。但购买这类房屋得不到法律和政策上的保障，存在着较大的风险。
小产权房买卖有以下问题
1、无法办理产权证书
很多人可能会觉得，买了房子之后都是有产权证书的，但是小产权房其实是没有产权的，因为这类房子是没有国家颁发的土地使用证和预售许可证，当然购房合同也不可能在房管局备案。所以你就不可能拿到一个合法合规，有效的房产证。
2、在想出手比较难
由于小产权房是没有产权证书的，大多数的购房者还是想要购买有产权的房屋的，如果业主想要向非集体成员的第三人出售小产权房，因其没有房产证而无法完成产权过户，小产权房屋购买人完全可以与其他人再次签订房屋买卖协议，达到一房二卖或是多卖的目的，第三人的利益将得不到保证。
3、购买压力大
虽然购买小产权房的总价比较低，但由于小产权房没有房产证，没有经过备案，就不能去银行做贷款，只能一次交清房款。对于购房者来说其实压力也很大。而且现在不能去银行做贷款，同理未来也不能拿这个房子去银行做抵押，再者买卖的时候可能也有很多的风险和坑。
4、质量可能存在问题
承建小产权房的开发商一般都是一些比较小的开发商，开发商在建设小产权房屋时，为赚钱可能会偷工减料，加上职能部门缺乏监管，存在严重安全隐患，在实际使用中很多小产权房出现墙体裂缝、房屋漏水等质量问题，更无法达到防风、抗震、防水、消防的建筑规范和标准。一旦发生房屋质量纠纷，购房者维权难，终只能自行承担损失。
虽然大家遇到拆迁赔偿的几率比较小，但也要考虑到房屋可能遇到的问题，因为购买小产权的购房者不是房屋合法所有人，无法对抗国家的征地和拆迁，购房者将来遇到拆迁，将很难得到补偿。若小产权房屋违反国家政策被强拆，购房人可能面临既无法取得房屋，又不能索回房款的尴尬局面。
《民法典》第三百六十二条，宅基地使用权人依法对集体所有的土地享有占有和使用的权利，有权依法利用该土地建造住宅及其附属设施。
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