中分居多年了该通过协议或起诉的方式离婚。即若夫妻想要离婚的，可以通过双方协商到婚姻登记机关办理离婚手续，经过三十天冷静期，即可领取离婚证，无法协议离婚的，可向人民法院起诉要求解除婚姻关系。法院确认夫妻因感情不和分居满二年，经调解无效的，应准予离婚。
《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
二、民法典离婚时夫妻财产该如何分割
离婚时夫妻财产分割方式如下：共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决；个人财产属于个人。
《中华人民共和国民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
第一千零八十八条
夫妻一方因抚育子女、照料老年人、协助另一方工作等负担较多义务的，离婚时有权向另一方请求补偿，另一方应当给予补偿。具体办法由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。
三、民法典因出轨离婚财产如何划分
因出轨离婚财产划分方式如下：共同财产夫妻分，夫妻协商失败的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。个人财产一般情况下还是归个人所有。
《中华人民共和国民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
第一千零八十八条
夫妻一方因抚育子女、照料老年人、协助另一方工作等负担较多义务的，离婚时有权向另一方请求补偿，另一方应当给予补偿。具体办法由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。
根据上述文章中的内容，相信已经解答了民法典中分居多年了该如何离婚的问题。在日常生活中，我们应该要多了解学习一些法律知识，这样在遇到有法律问题时才能作出正确的判断，才可以更好的运用法律的武器来保护自己的合法权益。如果还有相关法律问题需要咨询律师，可以点击下方“立即咨询”按钮，律图网会匹配专业律师为您服务。