申请工伤司法鉴定的程序：
在被确认为工伤后，然后去申请劳动能力鉴定；
再向社保经办机构索赔；
最后将赔偿费用交给劳动者。
如果单位没有去申请，则劳动者一方可按照法定的程序自行去申请。
《工伤保险条例》第十七条职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。
第十八条提出工伤认定申请应当提交下列材料：
(一)工伤认定申请表；
(二)与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料；
(三)医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。
二、认定工伤程序是怎样的
认定工伤程序如下：
一、申请。用人单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内提出工伤认定申请；单位未提出的，工伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内提出工伤认定申请。
二、审核。社会保险行政部门应当对工伤认定的申请进行审核，经审核对于提交的材料不全的，应当一次性书面告知工伤认定申请人需要补正的全部材料。补全材料或者材料本身就齐全的，社会保险行政部门受理申请。
三、核实。社会保险行政部门受伤工伤认定申请后对事故伤害进行调查核实，用人单位、职工、工会组织、医疗机构以及有关部门应当予以协助。
四、作出决定。社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。
《工伤保险条例》第二十条
社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。
三、工伤认定的程序有哪些
工伤认定的程序：
1.工伤保险部门根据申请人提交的材料出具收件回执；
2.基本资料收齐核实且符合受理条件后，工伤保险经办部门对符合受理条件的予以受理，出具受理通知书；
3.如申请人为受伤害的职工或其近亲属、工会组织，工伤保险部门应向用人单位发出关于伤亡事故调查处理的通知，核实有关情况；
4.工伤保险部门就正式受理之日起60日内做出工伤认定的书面决定，并于20个工作日内送达申请工伤认定的职工或者其近亲属、工会组织以及该职工所在单位。
《工伤保险条例》第十七条
职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。
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