二者的犯罪的客体、主体、主观方面都是一致的，主要区别在于客观方面的差别，后罪表现为伪造、变造、买卖国家机关公文证件、印章的行为。如果行为人盗窃、抢夺真实的国家机关公文、证件、印章后加以变造、买卖的，或毁灭买卖的国家机关公文、证件、印章的，应当怎样定罪?由于行为人先后触犯两种犯罪，而两者犯罪又具有牵连关系，因此应按牵连犯的原则论处。但二罪的法定刑的是一致的。
主要是：
(1)侵犯的客体不同，后三罪侵犯的客体是公私财物的所有权;
(2)侵犯的对象不同，后三罪侵犯的对象是一定的公私财物;
(3)犯罪目的不同，后三罪的犯罪目的意在非法占有或毁坏公私财物。如果行为人意欲盗窃、抢夺公私财物，但窃取、夺取的是国家机关公文、证件、印章，或同时有国家机关公文、证件、印章，而后予以毁灭、买卖或加以变造的，应当以盗窃罪、抢夺罪与本罪或与变造国家机关公文、证件、印章罪进行并罚。
(三)本罪与盗窃、抢夺武装部队公文、证件、印章罪的界限
(1)侵犯的客体不同，后罪侵犯的是国家武装部队的信誉和正常管理活动。
(2)侵犯的对象不同，后罪侵犯的是武装部队的公文、证件、印章。
国家机关印章在很多重要的场合都是有着非常关键性作用的，如果一旦出现了伪造或者毁灭国家机关印章的行为的很有可能会对国家的合法权益造成一定程度的侵害，因此将会需要相应的法律责任，并且对于造成的损失还需要进行相应的赔偿。
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