基本农田养殖场被强拆的，如果强拆程序合法，当事人只能配合。如果强拆程序不合法，当事人可以申请行政复议或向人民法院提起行政诉讼以维护自己的合法权益。
法律依据
《土地管理法》第七十七条
未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款;对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分;构成犯罪的，依法追究刑事责任。
超过批准的数量占用土地，多占的土地以非法占用土地论处。
在我们现实生活当中，相关的建筑物被强制性拆除，是否能够获得相关的赔偿，是否能够通过诉讼的方式来解决，应当根据实际情况来作出判断，因为有一些行政机关所作出的强制拆除的决定，是符合法律规定的。比如说对于违章违法的建筑物就可以限期责令拆除，然后再强制性拆除。
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