根据《刑事诉讼法》和六机关《规定》的规定，遇有下列情况不计入原有侦查羁押期限，即重新计算羁押期限：
1、在侦查期间，发现犯罪嫌疑人另有重要罪行的，自发现之日起依照《刑事诉讼法》第124条的规定重新计算侦查羁押期限。重新计算侦查羁押期限的，由公安机关决定，无需人民检察院批准，但须报人民检察院备案。
2、公安机关补充侦查完毕移送检察院后，人民检察院重新计算审查期限。
3、人民检察院补充侦查的案件，补充侦查完毕移送人民法院后，人民法院重新计算审理期限。
4、人民法院改变管辖的案件，从改变后的人民法院收到案件之日起重新计算审理期限
5、第二审人民法院发回重审人民法院重新审判的案件，原审人民法院自收到发回案件之日起，重新计算审理期限。
6、简易程序转为普通程序的案件，审理期限应当从决定转为普通程序之日起计算。
对于批捕的羁押刑期应当严格按照法律规定的情况来进行计算和处理，特别是对于已经批捕了的情况下，在我们国家，如果存在者判刑之前犯罪嫌疑人已经被采取了强制性措施，在限制人身自由的这段时间当中是完全可以折抵刑期的。不同的强制措施的方式，折抵刑期的时间长短也是不一样的。
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