认定分裂国家罪，应当注意以下两个问题：
1.本罪与非罪行为的界限
区分分裂国家罪与非罪行为的界限，要注意以下两点：一是行为人是否具备分裂国家、破坏国家统一的直接故意;二是是否具有组织、策划、实施分裂国家、破坏国家统一的行为。如果出于狭隘的民族主义或地方主义情绪，或者出于对国家某些民族政策的误解而实施了一些过激的行为，或者虽有一些思想上的分裂倾向，而缺乏任何具体的组织、策划、实施分裂国家、破坏国家统一的行为，都不应以本罪论处。
2.本罪与背叛国家罪的界限
本罪与背叛国家罪的区别主要表现在：
(1)犯罪主体不同。本罪的犯罪主体是一般主体，无论是中国公民、外国公民，还是无国籍人均可构成，没有特别限制;而背叛国家罪的主体是特殊主体，只能由中国公民构成。
(2)犯罪主观故意的内容不同。本罪行为人具有分裂国家、破坏国家统一的直接故意;而背叛国家罪的行为人具有勾结外国，危害国家主权、领土完整和安全的直接故意。
(3)犯罪客观方面的行为不同。
首先，本罪并不要求将“勾结外国”作为客观方面的要件内容;而背叛国家罪则将“勾结外国”作为客观方面不可或缺的必要内容。
其次，本罪是通过将中华人民共和国的一部分领土分离出去，脱离中央政府的领导，制造地方“独立”的割据局面而危害国家领土完整，是以对国家统一的侵害而危害国家安全;而背叛国家罪则是通过勾结外国，以对国家主权、领土完整和安全的侵害而危害国家安全。
破坏国家统一是分裂国家的一种特殊形式或结果，分裂国家则是破坏国家统一的行为手段。分裂国家的手段多种多样，不论此种行为是否造成危害结果，只要行为人具有组织、策划、实施分裂国家、破坏国家统一的活动事实，就构成犯罪。
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