农村宅基地房屋拆迁纠纷的处理方式有当事人之间协商解决;请求政府或其他组织调解或者依法进行处理;以及对行政处理决定不服的，当事人可以向法院提起行政诉讼来进行处理。
《中华人民共和国土地管理法》第十四条规定
土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决;协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理;个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。
二、与农民签订的拆迁安置协议有效吗
征收安置协议书是双方真实意思的表示，在没有违反法律强制性规定的情况下是具有法律效力的文件。表现在协议约定的权利义务受法律的保护和约束。依法订立的房屋征收补偿安置协议必须认真恪守，当事人任何一方均无权擅自变更或者解除。如果在履行协议中发生纠纷，协议约定的条款便是解决纠纷的主要依据。
拆迁补偿方式分货币补偿和房屋产权调换。若是货币补偿，则补偿金额根据被拆迁房屋的区位、用途、建筑面积等因素，以房地产市场评估价格确定。若是产权调换，则按照拆迁房屋和调换房屋各自的房地产市场评估价格计算，结清产权调换的差价。
在实行货币补偿形式的情况下，需要对被拆迁房屋的市场价格进行评估，在实行房屋产权调换形式的情况下，需要同时对被拆迁房屋和所调换房屋的市场价格进行评估，以作为结清差价的依据。至于房屋的评估机构的选择，应由拆迁人和被拆迁人共同选定，如双方未能就选定评估机构达成合意，则由双方各提出一至两家评估机构，抽签决定。
三、宅基地拆迁补偿形式有哪些
(一)、货币补偿
货币补偿是通过不同的法定依据由专业的评估机构对被拆迁房屋进行专业的估价，生成有据可循的多远组成的补偿金额。以下介绍三种法定评估依据：
市场评估价是指被拆迁房屋的房地产市场价格，是由符合规定的专业估价机构，根据估价目的，遵循估价原则，按照估价程序，选用适宜的估价方法，并在综合分析影响房地产价格因素的基础上，对房地产在估价时点的客观合理价格或价值进行估算和判定的活动。
商品房交易均价是指同区域同类型普通住宅商品房交易平均价格，由相关部门每季度定期汇总测定并公布。
重置价是指由估价机构采用估价时点的建筑材料和建筑技术，按估价时点的价格水平，判定出重新建造与估价对象具有同等功能效用的全新状态的建筑物的正常价格。
上述三种价格都是拆迁补偿的法定依据，但用途各有不同，在不同情形下分别适用。
(二)、产权置换
产权置换也被称作产权调换，根据评估方法不同，有两种置换方式。价值标准产权置换指的是依照法定程序，通过对被拆迁人房屋的产权价值进行评估，之后再以新建房屋的产权予以价值的等价置换。面积标准产权置换指的是以房屋建筑面积为基础，在应安置面积内不结算差价的异地产权房屋调换。
产权置换分为两种形式：
异地安置。异地安置是指由于开发商项目不涉及住宅或由于该地块容积率原因，不能进行回迁安置，只能选择在其他地块上新建安置房，再通过产权的增减尽量以等价价值做到产权置换。
回迁安置。回迁安置是指开发商拆迁重建项目能够完成回迁安置，通过产权置换比例完成回迁安置。
(三)、两者相结合的补偿方式
顾名思义，这种补偿方式就是指既给货币补偿又给产权置换。
由于我国城市化进程与其他诸多客观因素，导致房价和地价的虚高，因此造成了诸多不能够单单用货币补偿或者产权置换解决的问题，所以就出现了货币补偿和产权置换相结合的补偿方式。
宅基地拆迁纠纷怎么处理的问题本文进行了解答，宅基地拆迁发生了纠纷，可以先通过协商的方式处理，如果协商无法达成一致意见，被拆迁人可以向法院提起诉讼。如果您还需要咨询相关的其他问题，可通过点击下方“立即咨询”按钮，我们会匹配专业的律师为您解答问题。
