拆迁协议有纠纷可以办房产证，原则上按被拆房地产的性质进行登记发证。
拆迁安置房是政府进行城市道路建设和其他公共设施建设项目时对被拆迁住户进行安置所建的房屋，通过正规拆迁程序取得的拆迁安置房满五年可以办理房产证，通过房产证确认房主取得的房屋所有权。
二、拆迁安置房房产证的办理需要提交什么资料
(2)登记申请书及询问记录单原件;
(3)房屋拆迁安置补偿协议书原件或征用房屋协议书原件(如集体土地权属来源不清的,无需提供);
(4)被拆房屋原权属证明或合法建造房屋的相关资料原件(如集体土地权属来源不清的,需提供区建设局出具的安置确认证明);
(5)城市配套费等的缴交凭证原件(必要时告知);
(6)申请人登报声明原件(必要时告知)。需要注意的是,所提交的复印件均须与原件比对确认。
(7)超面积自购部分,视同购买商品房,提交相应资料的原件;
(8)房屋涉税证明的原件(可先提交其受理单复印件);
(9)发生权属转移的相关证明原件(转让、继承、赠与等有效文书);
(10)具有相应资格测绘机构出具的房产测绘成果图原件;
(11)拆迁安置合同原件,含补偿清单或结算清单原件;
(12)拆迁安置产权登记证明书原件。
三、拆迁安置房房产证办理的流程是什么
初始登记:依据相关资料按每幢楼办理在拆迁人名下;
转移登记:依据初始登记的房屋所有权证和《拆迁安置协议》等相关资料登记到每个安置户名下,并颁发房屋所有权证。
还有必须注意的事项是:
1、如果被拆迁人属港、澳、台及外籍人士,只有出具国家相关部门给出的证明才可以办理房产证;
2、如遇被拆迁人去世的情况,在办理登记手续之前应先办理被拆迁房屋权属的继承手续。
四、拆迁房房产证办理的费用是怎么收取的
1、拆迁房办理房产证的契税:拆迁房的建筑面积如果在120平方米以下包含120平方米,并且拆迁房成交单价低于4600元每平方,而且拆迁房内小区绿化容积率在1.0以上包或1.0,只要拆迁房符合以上全部条件的,拆迁房契税要按照拆迁房成交价钱的1.5%缴纳。如果有任何一条件不符则需要缴纳拆迁房成交价钱的3%;
2、拆迁房办理房产证的劳务费:每平方3元;
3、拆迁房办理房产证登记费:拆迁房面积在100平方米以下的要缴纳90元的登记费;如果拆迁面积在100-200平方米的需要缴纳100元的登记费;拆迁房面积每增100平方米的则需要加收10元;
4、拆迁房测绘费:拆迁房面积50平方米以下的需要缴纳80元;拆迁房面积50-100平方米的需要缴纳120元;拆迁房面积101-200平方米的需要缴纳160元 ;拆迁房面积201-300平方米的需要缴纳200元
5、拆迁房办理房产证的印花税:需要缴纳拆迁房成交价的0.03%。
五、房屋拆迁赔偿需要注意哪些问题
1、拆迁人应当对被拆除房屋及其附属物的所有人，按规定给予补偿。补偿标的以房屋所有权证所列资料为准。拆除违法建筑、临时摊点、超过批准期限的临时建筑或拆迁通告公布后改建、扩建、装饰的设施，以及其他原约定不补偿的部分，均不予补偿。
2、搬迁费和临时安置费用，具体数额各市一般都已确定具体数额及计算方式，详见各地出具标准，所列算的补偿标准，是以大众化被拆迁人自主搬迁和过渡方式进行的计算。如果拆迁人提供周转房，则无需支付临时安置费。
