(1)行为的目的不同。集资诈骗罪的行为人必须具有非法占有所募集的资金的目的，包括据为已有、据为单位或者他人所有。而非法吸收公众存款罪的行为人主观上则不具有非法占有的目的，而是通过非法吸收、变相吸收公众存款而用于营利活动，以牟取暴利。实践中，判断行为人是否具有“非法占有”的目的是区分集资诈骗罪与非法吸收公众存款罪的关键。
(2)行为方式不尽相同。前者是使用诈骗方法，即使用捏造事实、编造谎言或者隐瞒真相的方法骗取公众财物;而后者则不要求必须使用诈骗方法，哪怕是以真实的方法来吸收公众存款，也可以构成非法吸收公众存款罪。
(3)侵犯的客体不同。前者主要侵犯的是公司财产的所有权，而后者主要侵犯的是国家金融管理秩序，非法集资诈骗的数额并不是量刑的唯一依据。
单位进行集资诈骗，数额在50万元以上的，应当认定为“数额较大”;数额在150万元以上的，应当认定为“数额巨大”;数额在500万元以上的，应当认定为“数额特别巨大”。
二、非法集资诈骗罪起罪金额为多少
关于非法集资诈骗罪的起罪金额，个人进行集资诈骗，起罪金额为10万，单位进行集资诈骗，起罪金额为50万。
个人进行集资诈骗，数额在10万元以上的，应当认定为“数额较大”;数额在30万元以上的，应当认定为“数额巨大”;数额在100万元以上的，应当认定为“数额特别巨大”。
单位进行集资诈骗，数额在50万元以上的，应当认定为“数额较大”;数额在150万元以上的，应当认定为“数额巨大”;数额在500万元以上的，应当认定为“数额特别巨大”。
在当代的社会，现在我们国家法律当中所规定的犯罪行为有一些是比较相似的，所以就会导致普通老百姓混淆，但实际上从刑事法律构成要件上来看的话，两者是会存在显著区别，比如说集资诈骗罪和非法集资罪之间，在行为目的以及侵犯的客体上都不一样。
