用人单位扣留劳动者的劳动合同，违反了《劳动合同法》“劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份”的规定。法律依据：《劳动合同法》第十六条规定，劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效。劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。
(一)增加维权难度。劳动合同是劳动者的护身符，用人单位在劳动者签名后拒绝将劳动合同书交给劳动者，不让劳动者知晓劳动合同的内容，造成劳资双方的信息严重不对称。劳动合同是规定劳资双方的权利和义务，一旦劳动者的合法权益受到侵害发生劳动纠纷，劳动者无书面劳动合同就处于无“据”可查的处境，指望以其他证据予以证明，是非常困难的!不但劳动者的合法权益难以实现，同时也给仲裁、法院查清案件增加了很大难度。
(二)违法成本小。虽然扣留劳动者的劳动合同是违法行为，但是有些用人单位还是屡见不鲜，其主要原因还是该行为所承担的风险很小。劳动合同法规定，对于用人单位未将劳动合同文本交付劳动者的，一般是先责令改正，这就给了用人单位一个缓冲期。同时，规定给劳动者造成损失的，承担赔偿责任，但是劳动者想要证明自己的损失与未将会劳动合同将会劳动者之间存在因果关系是非常困难的。可以说扣留劳动合同，可以让用人单位以很小的风险来规避自己的法律责任。
公司违反劳动法并且扣押劳动者的劳动合同，劳动者可以要求公司提供一份劳动合同给劳动者，公司不提供，劳动者可以反馈的公司所在地的人力资源与社会保障局申请劳动仲裁，要求公司提供劳动合同，公司违反《劳动合同法》第38条内容，劳动者可以立即解除劳动合同，不需事先告知用人单位，并要求支付补偿金(每工作一年支付一个月工资)。公司违规解除劳动合同需要支付双倍补偿金的赔偿金。
《劳动合同法》
第三十八条 用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：
(一)未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的;
(二)未及时足额支付劳动报酬的;
(三)未依法为劳动者缴纳社会保险费的;
(四)用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的;
(五)因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的;
(六)法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动者劳动的，或者用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全的，劳动者可以立即解除劳动合同，不需事先告知用人单位。
用人单位把员工原本的劳动合同给扣押了，这个时候员工可以直接到劳动局申请劳动仲裁，因为用人单位这样的做法是非常错误的，会给劳动者带来损失，在和用人单位签订劳动合同时一定要注意劳动合同中所约定的条款，而且劳动合同签订之后，员工和用人单位一一人一份。
