物权保护纠纷确认合同效力应该到相关部门做好登记，拿到的合同是有法律效力的。房产作为不动产，其物权确定应依循物权公示原则。我国不动产物权采登记生效主义原则。相关法律规定规定：不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力;未经登记，不发生效力，但法律另有规定的除外。
关于不动产物权变动模式，系以登记生效要件为原则，登记对抗要件或登记处分要件为例外。但物权公示与否影响的是物权变动而非影响合同效力。相关法律规定规定：当事人之间订立有关设立、变更、转让和消灭不动产物权的合同，除法律另有规定或者合同另有约定的除外，自合同成立时生效;未办理物权登记的，不影响合同效力。
物权变动不以登记而以事实行为的成就为标志。未办理物权登记而处分该物权虽不能发生物权变动，但却不影响合同效力。当事人对可合理期待将来取得合法物权的不动产签订的买卖合同或者协议效力不应受制于物权登记与否。
对事物的认识要建立在对事物本体把握基础之上。一般而言，合同成立建立在双方平等自愿基础之上。合同以书面形式的确定其内容，而标的作为合同内容的一个重要方面更需要明确具体。但在合同签订乃至履行过程中，由于客观原因的限制，双方并不能通过文字准确表达双方的真实意思，故对于相关合同内容的解释应全面考虑与交易有关的环境因素，以明确双方真实意思表示。这也对日常生活中签订合同的当事人提出了更高的要求，本着风险自负的原则，以法律规范自己的行为，参与各种法律关于以利生活。
物权保护纠纷确认合同的效力问题不仅仅局限于物权是否有做记录，因为没有做记录的合同，同样也是可以有法律效力的，人民法院的法官可以以这份合同会有效证据，当发生纠纷时，可以通过这份材料来维护合法人利益。
