如果施工合同不备案是有效的，取消施工合同备案、建筑节能设计审查备案等事项。将工程质量安全监督手续与施工许可证合并办理。
法律依据：《国务院办公厅关于开展工程建设项目审批制度改革试点的通知》第(八)项
1、取消施工合同备案、建筑节能设计审查备案等事项。
2、将工程质量安全监督手续与施工许可证合并办理。
建设工程施工合同是指发包方(建设单位)和承包方(施工人)为完成商定的施工工程，明确相互权利、义务的协议。
根据《民法典》的相关规定，合同生效有两种情形，第一种是合同依法成立时合同立即生效，另外一种是合同成立后还应当办理各种手续后才生效。
根据《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第四十七条规定，对于走招投标程序的建设工程施工合同，合同自投标人中标时就已成立，但法律并未规定需经登记备案才生效。这条规定是国家政府管理部门采取的行政管理方法，主要目的是为了严格管理和监督建设工程合同。法律和行政法规中的强制性规定，有的是属于行政管理规范，如果合同一方的当事人违反了行政管理规范规定，那么应当受到相应的行政处罚，但是该处罚不影响民事合同的效力;
由于建筑施工合同自合同中标时即成立并生效，所以承发包双方均享有相同的合同权利，应依法履行各自的合同义务。如发包公司违反合同约定将工程擅自再发包给其他建筑公司，属违约行为，发包公司应该依法承担相关违约责任，承担自己的义务。
施工合同未经备案是否有效其实在法律中尚未明确规定，建筑施工合同的备案是属于行政管理性强制规定的，该项不属于违反法律、行政法规的效力性强制规定，该备案仅仅是部门、地方规章规定的。因为签订合同的双方是平等、自由、自愿的，所以合同的生效不需要审批，也不需要以备案为生效要件。因此施工合同有没有备案是不一定影响合同的有效性
在我们的日常生活中，如果是遇到了需要与他人签订施工合同的情形的时候，是要注意相关的民事合同的权益的保护以及内容条款的书写的，此时也是为了更好的保护我们的权益。
