1、小产权房产没有国家颁发的房产证。无论是村委会还是乡政府颁发的产权证都属于无效证件，在法律上不予承认。
2、小产权住房无法上市流通。由于小产权住房没有国家认可的房产证明，所以不具备进行房产转让、处分、收益和继承等权利。
3、小产权房产无法过户。由于小产权房产本身就不具备相应的产权，所以也不具备过户的权利。
4、小产权住房没有占地补偿。遇到政府或合法开发商征用小产权房产占地的情况时，小产权房主只能得到很少或无法得到相关的补偿。因为该小产权占有的土地属于当地村委会或乡政府所有，补偿款会直接划给当地村委会或乡政府。
5、小产权无法办理银行贷款。因为办理贷款买房需要以该房屋的产权证办理抵押登记手续。没有国家出具合法产权证的房产银行的不会放款的。
6、户口无法迁入。由于购买小产权住房无法迁入户口，所以购房人及其子女无法获得当地的免费医疗和义务教育资源。
《土地管理法》第十一条，农民集体所有的土地依法属于村农民集体所有的，由村集体经济组织或者村民委员会经营、管理；已经分别属于村内两个以上农村集体经济组织的农民集体所有的，由村内各该农村集体经济组织或者村民小组经营、管理；已经属于乡（镇）农民集体所有的，由乡（镇）农村集体经济组织经营、管理。
