合同 补充协议 或者称为 协议补充 ，是指当事人对于合同中的内容没有约定或者约定不明确的，而达成的协议。 补充协议 是相对于已经存在的合同而言的， 协议补充 就是通过协议方式补充已经存在的合同中存在的漏洞。因此，已经存在的合同与 补充协议 之间是主从关系。已经存在的合同是主合同， 补充协议 是从合同。已经存在的合同作为主合同不以 补充协议 的存在为前提，或者说不受 补充协议 的制约而独立存在。反之， 补充协议 必须以已经存在的合同的存在为前提，自身不能独立存在。尽管 补充协议 相对于主合同而言没有独立性，但是其本身也是协议。因此， 补充协议 的成立和生效与主合同的成立和生效的依据相同。
1、主合同与补充合同
主合同与补充合同一般不会同时产生，会有时间差，主合同成立时间在前，补充合同成立时间在后，这是补充合同产生的时间规律。 补充合同是主合同的从属合同，补充合同依附于主合同而成立，没有主合同，就不会产生补充合同，这是主合同与补充合同的基本关系。 主合同因为有了补充合同，所以使得主合同原意更准确、更完善、更具有可操作性。 补充合同的编号往往是以主合同为依托而表达的，如__号合同补1、补2，这是强调二者主从关系的实质体现。 因为有了补充合同这种特殊形式，能够保证双方履约顺利，合同纠纷减少。
2、补充合同的效力
当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。 时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。 如果仍以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。
3、补充合同与合同变更
补充合同对主合同补充太多的新约定，则该补充合同就难以称之为补充合同了。 补充合同对主合同修改得太多，超过了适当的量，或补充合同对主合同的实质要件进行了较大的补充修改。 比如对价格条款，技术标准，履约期限等约定进行了不利于其中一方的修改，这也不能称之为补充合同。 这些补充和修改已经符合合同变更的要求，应该称之为合同变更。
