在我国的法律体系中，对于轻伤案件来说，即使已经达成了调解协议，通常情况下仍然无法直接撤销该案件。
这主要是因为轻伤案件可能涉及到了故意伤害罪的指控，作为一种公共利益性质的刑事诉讼案件，其职责由国家专门机构（即检察院）负责起诉与监督。
然而，若能够得到受害者的谅解并达成调解协议，法院在量刑时将酌情减轻处罚。
当然，如果犯罪行为情节极为轻微且社会危害性较小，甚至不能被视为犯罪行为，那么公安机关有权做出撤销案件的决定。
然而，这需要根据整个案件的具体情况进行全面评估，例如伤害的方式、原因以及实际危害结果等等多个方面。
因此，尽管调解协议对案件处理具有积极的推动作用，但是否能够直接导致案件撤销，还需视具体情况而定。
