小包工头可以通过以下方式讨要工程款：
1.向劳动监察大队投诉。用人单位违反国家规定，拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以向劳动行政部门投诉，劳动行政部门应当依法处理。
2.劳动仲裁。发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
3.向法院起诉。劳动者有欠条的，可以携带身份证、户口本、欠条、起诉状及副本向法院提起民事诉讼，法院判决用人单位支付欠款，但是单位仍不支付的，劳动者可以自判决书规定的期限届满后两年内向法院申请强制执行。
4.用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
劳动者应当提前三十日以书面形式通知用人单位解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者未提前提出的，应当赔偿用人单位的经济损失。
《劳动争议调解仲裁法》第九条
用人单位违反国家规定，拖欠或者未足额支付劳动报酬，或者拖欠工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金的，劳动者可以向劳动行政部门投诉，劳动行政部门应当依法处理。
