运输增值税发票有4%、6%、13%、17%的税率，一般纳税人取得增值税发票可抵扣相应税额，小规模纳税人和一般纳税人开具增值税票都要交相应的税额。普通发票也有4%、6%、13%、17%税率，无论小规模纳税人还是一般纳税人取得普通发票都不能抵扣，小规模纳税人和一般纳税人开具普通发票都要交相应的税额。
法律依据：
增值税暂行条例实施细则第三十四条
有下列情形之一者，应按销售额依照增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项税额，也不得使用增值税专用发票：
(一)一般纳税人会计核算不健全，或者不能够提供准确税务资料的;
(二)除本细则第二十九条规定外，纳税人销售额超过小规模纳税人标准，未申请办理一般纳税人认定手续的。
