实践中电子咯的合同的效力认定有差异，一般只要合同依法成立，一般是由效的，但是往往用人单位和劳动者会因电子劳动合同的具体内容产生争议，从而引起对合同效力的争议。
首先，你遇见的电子协议，是否能够确认填写者的身份就是一个问号。网上协议签署，一般要注册一个账号，通过账号密码来识别用户身份。而劳动者在入职时，是否能够通过网上协议系统确认签署者的身份?即使有一个账号，如何能证明这个账号属于这个劳动者?这些问题在实践中不太容易解决。
其次，电子协议的系统由谁管理，是否存在被纂改的可能?公司内部的系统，数据库往往由公司管理。具有管理员权限的人，登入到数据库中，就可以修改劳动者输入的信息，这样的系统作为电子协议的保管方，是否具有公信力，很值得怀疑。
再次，一旦发生争议，如何再现这个协议的签署也是一个大问号。就现在大多数网上注册协议来看，签署后，再现时没有任何类似纸质协议签字这样的凭证，只能显示签署时间，或者模拟显示某人已签署的注记。发生争议后，诉讼方需要花费大量精力证明这一系统未经同意无法继续操作，才能推测用户注册时已经同意。对于用工双方来说，这种方式显然不太适合。
我国的《电子签名法》也表示：涉及婚姻、收养、继承等人身关系的合同不适用电子文书。劳动合同在某些方面同样具有人身属性的合同，它不太适合电子文书。
综合上述分析，为了避免诸多麻烦，还是建议用人单位在入职时与劳动者签署纸质的劳动合同。同时需要提醒提问者的是，劳动合同不能单就试用期签署合同，试用期必须包含在劳动合同期内。单独签订的试用期协议，试用期约定是不成立的。
