未经备案的商标使用许可合同只要具备法定生效要件通常是有效的，当事人另有约定的除外。即使商标使用许可合同未经备案，一般也不会影响该许可合同的效力，备案并不属于商标使用许可合同的生效要件。法律依据：《民法典》第一百四十三条 具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。 《最高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》第十九条 商标使用许可合同未经备案的，不影响该许可合同的效力，但当事人另有约定的除外。 第二十条 注册商标的转让不影响转让前已经生效的商标使用许可合同的效力，但商标使用许可合同另有约定的除外。
