股东要是出资有瑕疵，那有可能会影响到他的股东资格认定，但这也不是绝对的。
通常来讲，就算股东没履行好或者没完全履行出资义务，也不是说就一定得失去股东资格。
在司法实践里，法院会把好多因素都综合起来考虑，像出资的瑕疵程度、股东自己有没有主观过错、公司以及其他股东的态度之类的。
要是出资的瑕疵比较小，并且股东在其他方面很积极地履行了股东的义务，而且公司和其他股东也都认可他，那很可能还是会认定他有股东资格的。
不过，如果出资的瑕疵特别严重，都到了根本违约的地步了，而且经过公司催告之后，在合理的期限内还是没把出资给补足，那很有可能就会被认定为不具备股东资格。
总之，股东出资有瑕疵对股东资格的认定是有一定影响的，得根据具体的情况来进行判断和处理。
