员工申请劳动仲裁以维护自身权益的程序如下：首先，务必明确有管辖权的劳动仲裁委员会，通常是用人单位所在地或者劳动合同履行地的仲裁委。
这是启动仲裁程序的关键一步，只有找准了管辖地，仲裁申请才可能被顺利受理。
其次，精心准备仲裁申请书。
需清晰写明申请人即员工自身以及被申请人即用人单位的基本信息，明确仲裁请求，像要求支付赔偿金、工资等具体事项要详细列出。
同时，要全面收集相关证据，像劳动合同能证明劳动关系，工资条体现工资情况，辞退通知则说明被辞退的事实，这些证据都对仲裁结果有着重要影响。
然后，将仲裁申请书和证据材料一并提交给仲裁委。
仲裁委收到后会进行严格审查，若符合受理条件，便会在规定时间内受理，并及时通知双方当事人。
之后，仲裁委会依法进行开庭审理，双方在此过程中分别进行举证、质证、辩论等环节，充分阐述各自观点和理由。
最后，仲裁委会作出仲裁裁决，该裁决对双方具有法律效力。
