购买经济适用房主要存在以上三种风险：
1、借名购买经济适用房。即实际购买人不具备购房资格，以符合购房条件的其他人名义进行购房。
这类购房行为将被认为侵犯城市低收入住房困难家庭的平等购房和获得房屋的权利，非法占有社会公共资源，使国家的有关土地、房产税费流失，损害了社会公共利益，从而构成无效买卖合同。
2、未满5年即交易。《经济适用住房管理办法》第三十三条规定，经济适用房购房人拥有有限的产权。
购买经济适用住房不满5年，不得直接上市交易，购房人因特殊原因需转让经济适用住房的，可由政府按照规定进行回购。
因此，如果经济适用房的购房者在取得房屋契税完税凭证及房屋所有权证尚不满5年的情况下；
将房屋出售给其他人，相应的买卖合同一般会被认为违反了已购经济适用房不满5年不得直接上市交易的政策规定而无效。
3、无法过户登记的情形。购房者在取得房屋契税完税凭证及房屋所有权证之后满5年的，可以按照政府标准向政府交纳土地收益等价款；
取得完全产权。此时，购房者转让经济适用房的，政府住房保障管理部门可以优先购买，此为强制性规定。
若是政府住房保障管理部门未放弃回购，购房者则无权私自转让房屋，否则后续亦无法过户登记给其他人。
若是政府住房保障管理部门放弃回购，出具同意上市出售的书面意见，购房者方可将其房屋按照市场价格上市交易。
【法律依据】《民法典》第二百零八条规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，应当依照法律规定登记。动产物权的设立和转让，应当依照法律规定交付。
购买未满五年的经济适用房有什么后果 1、新修订的《经济适用住房办法》对经济适用住房上市交易作出了严格的规定：一是明确经济适用住房购房人拥有有限产权。二是明确购买经济适用住房不满5年，不得直接上市交易，购房人因特殊原因确需转让经济适用住房的，由政府按照原价格并考虑折旧和物价水平等因素进行回购。 2、也就是说购买未满五年的经济适用房风险相当大，经济适用房属于国家保障型住房。国家明文规定产权证未满五年是不能上市交易的，之间签订的协议也不会受到法律法规的保护， 3、经济适用房购买未满5年不得上市交易，这是硬性规定，很多人都知道。但事实上，经济适用房未满交易年限，房主私下与人签订买卖协议的事屡有发生，有人甚至直接把经适房“房票”卖给别人。
二手经济适用房出售方可依照市场价格出售住满5年的经济适用房。淡也只需按房屋成交额的10%补交综合地价款。补交的综合地价款的计算方式：例如有一套经济适用房，面积80平方米，原购价4000元/平米，按市场价4600元/平米出售，补交的综合地价款为4600×80×10%=36800元。按市场价出售经济适用房买卖政策 后不能再次购买经济适用房和其他保障性质的住房。 出售未住满5年的经济适用房。政策规定不允许按市场价格出售未住满5年的经济适用房，只能以不高于购买时的单价出售，且只能出售给符合经济适用住房购买条件的家庭或由政府相关部门收购。以原购价出售已购经济适用房的，出售方需提供原住房买卖合同、住房转让合同等证件。此类二手经济适用房的购买者必须符合经济适用房的购买条件方可购买。出售方以原价出售给有购买资格的人后，仍符合经济适用房购房条件的，还可以再次购买他处经济适用房买卖政策 。
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