发包人主张将工程款予以抵扣怎样处理

1、发包人主张将工程款予以抵扣，如果是双方在合同中有所约定的，一般应该支持。但是承包人依据建设工程施工合同要求发包人支付工程款，发包人主张将其已向合法分包人、实际施工人支付的工程款予以抵扣的，不予支持。
2、法律依据《民法典》
第八百零七条 发包人未按照约定支付价款的，承包人可以催告发包人在公道期限内支付价款。发包人逾期不支付的；除按照建设工程的性质不宜折价、拍卖的以外，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以申请人民法院将该工程依法拍卖，建筑工程的价款就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。