从底薪里扣除绩效合法吗?

社保个人缴费部分由单位从劳动者的总工资中代扣代缴，扣除社保及加班费后剩余的工资不得低于上海市最低工资标准（2015.4.1之前是1820元，2015.4.1后是2020元）。
除非劳动合同中有明确约定，否则劳动合同中所称的工资是指税前工资，也就是实际所得工资还需要扣除社保个人缴费部分和个人所得税。